company logo


Отсеивающий эксперимент

Для хемоорганотрофов нужны соединения азота в виде аминокислот и коротких пептидов, остающихся в растворимом виде после автоклавирования (пептоны) /16/. Возможно позитивное влияние и биогенных аминов (аспарагин, глутамин и т.д.). В большинстве случаев можно ограничиться только набором наиболее распространенных индивидуальных 20ти, хотя в некоторых случаях пептиды могут быть регуляторными факторами при синтезе конкретного ЦП. Аминокислоты могут требоваться не все, наиболее часто применяемые 20, а лишь некоторые. Для этого необходимо поставить многофакторный активный отсеивающий эксперимент и выбрать минимальную группу аминокислот, обеспечивающих нужный ВП.

При этом наиболее логично фиксировать макро и микро элементы и источник витаминов, в большинстве случаев, дрожжевой экстракт в разбавленном виде, чтобы уменьшить вклад аминокислот. Иногда применяют какой - ни будь поливитаминный комплекс медицинского или ветеринарного назначения, стерилизованный фильтрованием. Это более подходящий вариант, поскольку не содержит собственных аминокислот и пептидов, шире по содержанию витаминов, а возможные углеводы и прочие добавки можно учесть, либо значительно уменьшить их влияние разбавлением.

Поиск минимальной группы необходимых аминокислот можно делать, ставя ОЭ по методу случайного баланса на основе сверхнасыщенного плана Бута и Кокса (число проверяемых факторов больше количества испытаний в серии экспериментов) таб.1 /цит. по 1/. Названная серия испытаний позволяет проверить 20 наиболее часто встречающихся незаменимых аминокислот на 12ти экспериментальных точках. Для этого делают различные групповые выборки аминокислот из общего числа, по близкому к оптимальному плану, который проще всего отобразить в виде таблицы.

Единственность плана таб.1 не доказана, возможны импровизации. План близок к оптимальному, поскольку практически все теоретически возможные парные сочетания факторов учтены с равными частотами (большинство вектор - столбцов ортогональны). Но это в литературе не указано /1/. Согласно личному опыту, поисковые многофакторные планы на основе серии экспериментов достаточно устойчивы к небольшим промахам типа пропущенной или лишней добавки, в какую-либо проверяемую комбинацию.

Если хотя бы в одном опыте из серии экспериментов ВП достоверно отличен от 0, то задачу отсеивания можно считать решенной, поскольку найдена активная комбинация факторов среди весьма большого количества первоначально выбранных подозреваемых.

Таблица 1

План ОЭ “первого шага” Бута и Кокса для поиска минимальной группы необходимых аминокислот /1/

1

1

4

9

12

13

14

15

17

20

8

2

1

3

5

6

8

10

11

13

8

3

1

3

7

9

10

12

16

20

8

4

1

2

5

7

8

13

15

17

19

9

5

1

2

4

11

12

16

17

18

19

9

6

1

2

3

4

5

6

8

9

11

14

15

16

18

13

7

2

3

4

5

6

7

14

15

16

17

18

19

20

14

8

2

3

6

9

10

14

18

19

20

9

9

2

6

7

8

12

13

14

15

16

17

10

10

4

5

6

7

8

10

11

12

19

9

11

3

4

5

7

9

10

11

12

13

14

16

17

18

19

20

15

12

8

9

10

11

13

15

18

20

8

Перейти на страницу:
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10


Новое на сайте

Другие материалы


Copyright © 2013 - Все права защищены - www.timebiology.ru